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摘要 蛋白质功能通过与其他蛋白质和生物分子相互作用而实现其功能。蛋白质相互作用包含了一些蛋白功能分子机制的关键信息。过去的几年里人们在界面残基预测方面做出了大量的努力。现在界面预测和它的应用和发展前景状况良好。
界面预测方法依赖大范围的序列,结构以及物理性质来区别界面残基和非界面残基。输入的数据经过计算得到一个数值或者代表一个残基在蛋白界面内部的潜在可能性。对于在PDB中能够很好表示的复合物形式的蛋白,预测还是比较令人满意的,但是那些表示不太好的则不太令人满意。将来的发展方向主要是解决一些问题,如为多组分结构复合物建立结构模型。
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文字版来自: http://blog.sina.com.cn/s/blog_4e2c70250100blje.html
摸索着做了几个实验,试着把过程写下来,请大家指点。
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前面对libsvm-2.88目录下的README进行了部分翻译, 似乎需要的朋友比较多, 这下对tools目录下的README进行了翻译. 给需要的朋友.
这个目录中包括一些有用的程序:
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